More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0851 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 566 aa  1118    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  60.04 
 
 		 564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  45.41 
 
 		 558 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  49.37 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  45.83 
 
 		 507 aa  360  4e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  44.95 
 
 		 486 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  42.92 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 388 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 388 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  38.51 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 388 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  28.26 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  32.94 
 
 		 529 aa  193  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  28.33 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  26.77 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  27.27 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  26.68 
 
 		 403 aa  87.8  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  27.49 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  26.18 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  37.78 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  28.47 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  26.6 
 
 		 530 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  37.22 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  26.97 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  23.79 
 
 		 761 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  23.84 
 
 		 622 aa  77.4  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  28.81 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  27.97 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  27.19 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  23.62 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  28.18 
 
 		 612 aa  76.6  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.62 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  25.25 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  25.62 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  27.49 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  27.49 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  27.49 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  26.8 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  28.47 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  24.86 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  25.24 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  25.12 
 
 		 604 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  27.27 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  25.26 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  24.74 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0193  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  29.81 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.53 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0169  preprotein translocase subunit SecD  24.53 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  29.29 
 
 		 619 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  23.61 
 
 		 622 aa  73.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  26.13 
 
 		 604 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  24.08 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  27.09 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.99 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  28 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  25.45 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  25.8 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  26.45 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  35.96 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  26.45 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  26.45 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  26.45 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  29.53 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 843 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  26.45 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  27.43 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  34.86 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  26.28 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  26.9 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  25.9 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.57 
 
 		 750 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.54 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  26.9 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.25 
 
 		 849 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  30.2 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  24.16 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.84 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  36.07 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  26.84 
 
 		 622 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.47 
 
 		 848 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  30.11 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  29.46 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  28.35 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  25.13 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  30.2 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  26.51 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>