More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1147 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  85.57 
 
 		 388 aa  672    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 388 aa  768    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  96.13 
 
 		 388 aa  742    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  96.65 
 
 		 388 aa  749    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  71.39 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 558 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 566 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  36.16 
 
 		 485 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  33.07 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  31.7 
 
 		 549 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  31.74 
 
 		 546 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  30.85 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  28.46 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  27.84 
 
 		 411 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 		 564 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.88 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  28.81 
 
 		 410 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  28.31 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  27.79 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.24 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  26.04 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  25.71 
 
 		 470 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  25.68 
 
 		 471 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.53 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  27.98 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  24.54 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  24.54 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  25.35 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  27.81 
 
 		 735 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  30.13 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.67 
 
 		 853 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  27.44 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  27.92 
 
 		 503 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  27.61 
 
 		 512 aa  93.2  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  27.01 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  23.5 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  24.66 
 
 		 531 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  23.5 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  26.16 
 
 		 534 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  25.93 
 
 		 554 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27.84 
 
 		 638 aa  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  27.25 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  25.41 
 
 		 534 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  28.35 
 
 		 449 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.92 
 
 		 844 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  23.59 
 
 		 554 aa  86.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.92 
 
 		 845 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  22.76 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 843 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  28.24 
 
 		 619 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  28.52 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  25.36 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  26.29 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.73 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  27.32 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  25.37 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  25.57 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.44 
 
 		 849 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  24.79 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  26.87 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.93 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  23.89 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  26.28 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  23.58 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.43 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.33 
 
 		 844 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  26.73 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  24.4 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  23.24 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  31.25 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  28.34 
 
 		 605 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  23.24 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.14 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  26.22 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.6 
 
 		 844 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  23.48 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  23.48 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  26.05 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  24.93 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  23.61 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  23.37 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  25.65 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.93 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.11 
 
 		 755 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  27.99 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  23.47 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  28.35 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 785 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  26.74 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>