274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0280 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 497 aa  996    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  57.88 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  57.56 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  56.16 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  55.32 
 
 		 485 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  37.57 
 
 		 558 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  42.92 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  43.56 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  34.69 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  30.78 
 
 		 537 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  31.4 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  30.4 
 
 		 549 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  35.26 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  35.39 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  30.15 
 
 		 546 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  24.87 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.87 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.91 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  26.58 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  22.76 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.39 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  28.62 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  26.17 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.11 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.86 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  24.12 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  23.74 
 
 		 489 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  24.51 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  28.41 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  25.19 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  26.6 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  24.62 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  24.81 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  25.54 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  22.64 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  23.88 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  22.94 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  25.36 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  22.94 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  24.78 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.62 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  25.71 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  24.18 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.78 
 
 		 759 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.78 
 
 		 759 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.85 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  24.63 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  24.37 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  23.39 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  25.79 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27.39 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  23.37 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  29.54 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  26.37 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.66 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  26.62 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  22.99 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.36 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.36 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  26.89 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  22.99 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.23 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.36 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  29.41 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.08 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  21.4 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  27.51 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  27.53 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  26.88 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  30.14 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  25.98 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  24.57 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  22.93 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  24.72 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  26.63 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  24.85 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  24.72 
 
 		 613 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  23.4 
 
 		 735 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  28.25 
 
 		 625 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  23.43 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  26.48 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  27.86 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.38 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  29.15 
 
 		 605 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.29 
 
 		 755 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.65 
 
 		 848 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  26.42 
 
 		 613 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  22.55 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  24.52 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  26.67 
 
 		 532 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>