245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0745 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  77.18 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  58.77 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  56.23 
 
 		 293 aa  325  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  58.5 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  41.16 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  43.43 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  39.15 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  43.57 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  40.78 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  34.51 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  32.96 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  33.6 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  35.06 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  31.17 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  25.27 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  22.46 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.66 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.55 
 
 		 750 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.41 
 
 		 762 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  24.15 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  23.02 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  25.53 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  20.07 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  21.66 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  20.07 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  25.43 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  20.07 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  20.88 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  26.34 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  22.9 
 
 		 759 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  22.92 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  23.73 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  26.97 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  25.59 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  24.1 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  24.76 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  23.64 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  23.64 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  23.64 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  23.64 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  23.64 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  21.5 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  25.59 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  23.45 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  23.58 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.21 
 
 		 759 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  22.78 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.21 
 
 		 759 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  18.93 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  24.54 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.27 
 
 		 856 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.55 
 
 		 763 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  23.21 
 
 		 735 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.56 
 
 		 754 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  21.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  22.63 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  22.46 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  22.12 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  24.11 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  23.4 
 
 		 423 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  22.03 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.73 
 
 		 754 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.73 
 
 		 754 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.66 
 
 		 754 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.66 
 
 		 754 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  22.1 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  21.69 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  23.96 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  24.45 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.09 
 
 		 755 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  23.61 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.89 
 
 		 754 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.65 
 
 		 752 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.02 
 
 		 754 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  22.18 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  22.64 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  22.22 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  21.93 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  23.72 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.27 
 
 		 754 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  23.58 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  25.81 
 
 		 761 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  23.98 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  22.7 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  23.53 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  26.57 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  22.83 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  21.69 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  28.31 
 
 		 558 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  23.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  25.73 
 
 		 389 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  23.48 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  21.7 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.97 
 
 		 754 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  23.01 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>