253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1016 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  61.92 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  61.57 
 
 		 281 aa  343  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  61.21 
 
 		 281 aa  341  9e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  65.12 
 
 		 291 aa  338  7e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  37.89 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  34.32 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  50.57 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  36.9 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  38.22 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  34.43 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  34.57 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  25.37 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  27.06 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  25.46 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  22.59 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  24.43 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  25.09 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  25.94 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  26.75 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  24.47 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  24.47 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  24.47 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  24.71 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  25.94 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  27 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  24.23 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  26.17 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  23.08 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  22.89 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  23.08 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  24.8 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  23.72 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  26.09 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.35 
 
 		 853 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  26.75 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.4 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  22.67 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  23.77 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.4 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  26.44 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  23.55 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  24.39 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  30.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  25.88 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  25.19 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  29.32 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.25 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  26.32 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  24.12 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  25.11 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.97 
 
 		 1128 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  27.63 
 
 		 734 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  24.38 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  25.76 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.28 
 
 		 899 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  22.09 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  21.75 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  24.79 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  24.66 
 
 		 761 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  24.09 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  25.31 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  24.89 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  24.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  21.22 
 
 		 325 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.8 
 
 		 759 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>