188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2708 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  77.18 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  57.56 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  57.38 
 
 		 293 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  59.86 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  44.48 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  38.73 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  36.18 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  42.96 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  39.18 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  34.86 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  34.32 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  32.52 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  33.2 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  32.79 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  26.06 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  25.17 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.93 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.46 
 
 		 750 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  27.51 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  23.05 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.31 
 
 		 763 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  23.29 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  23.05 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  23.05 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  25.62 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  24.18 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25 
 
 		 856 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  27.56 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  23.08 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  25.88 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  25.74 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  25.74 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  25.74 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  25.74 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  25.74 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  26.2 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  24.05 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.67 
 
 		 759 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.67 
 
 		 759 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  25.88 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  28 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.35 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.83 
 
 		 750 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  25.76 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  25.76 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  24.15 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  25.08 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.02 
 
 		 754 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.79 
 
 		 754 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  25.09 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.4 
 
 		 754 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  27.5 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  22.98 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  25.25 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  21.83 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  24.18 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  26.61 
 
 		 761 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  25.88 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  24.42 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.3 
 
 		 754 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.97 
 
 		 785 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  24.29 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.14 
 
 		 853 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  25.78 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21.97 
 
 		 785 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  23.15 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  22.34 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  25.44 
 
 		 735 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  24.41 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  22.33 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  24.52 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.03 
 
 		 759 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  25.56 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  22.07 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.09 
 
 		 755 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  26.32 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  22.03 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  25.08 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  25.98 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  26.49 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>