243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0837 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  81.85 
 
 		 281 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  81.14 
 
 		 281 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  80.78 
 
 		 281 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  65.12 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  37.99 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  38.49 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  40.28 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  54.02 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  43.68 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  44.97 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  43.42 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  32.98 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  31.17 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  26.74 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  26.15 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  25.95 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  25.56 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  28.14 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  28.14 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  28.14 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  26.94 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  28.41 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  27.83 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  28.14 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  28.68 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  27.1 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  24.82 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  25.82 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  22.22 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  25.09 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  25.76 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  22.05 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  28.14 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  24.82 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  25.95 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  26.35 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  25.38 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  25.38 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  25.38 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  24.26 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  24.24 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  24.76 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  24.24 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  27.2 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  23.05 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.35 
 
 		 762 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  24.24 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  24.24 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  24.14 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  23.66 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  23.66 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  24.26 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  27.38 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  27.38 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  27.31 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  24.75 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  21.88 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  23.66 
 
 		 759 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  25.38 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  22 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  26.14 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  27.1 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  25.83 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  26.89 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  26.81 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  26.87 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  25.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.28 
 
 		 853 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  25.2 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  27 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  25.29 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  26 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  25.31 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  25.19 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  25.2 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  24.8 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>