152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1321 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  57.88 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  60.66 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  59.09 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  53.23 
 
 		 293 aa  311  5.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  40.54 
 
 		 292 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  41.81 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  39.12 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  43.19 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  43.3 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  41.89 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  38.28 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  35.04 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  47.65 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  34.65 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  25.09 
 
 		 759 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  24.62 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  23.15 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.22 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  24.76 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  24.22 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  28.96 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.77 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  24.11 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  22.38 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.74 
 
 		 856 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  26.7 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  27.83 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  24.43 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  22.38 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  25.45 
 
 		 461 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  29.25 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  21.58 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  22.37 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0194  preprotein translocase subunit SecF  24.32 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0170  preprotein translocase subunit SecF  24.32 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.13 
 
 		 991 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  23.33 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1570  protein-export membrane protein SecF  24.41 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  25 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.4 
 
 		 846 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  22.18 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  21.72 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  23.74 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  21.48 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  24.73 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  24.66 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  26.79 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  25 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  23.83 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  23.81 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  21.72 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  21.72 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  22.92 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  26.39 
 
 		 989 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  23.85 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  21.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  21.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  21.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  22.36 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  21.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  21.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  22.4 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  22.26 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  25.2 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.84 
 
 		 846 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  28.4 
 
 		 835 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.86 
 
 		 856 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  21 
 
 		 750 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  23.79 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  23.83 
 
 		 849 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  23.12 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  21.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  21.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  21.31 
 
 		 412 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  21.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  23.74 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  22.6 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  23.92 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  23.67 
 
 		 535 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  22.06 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  22.06 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  23.99 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  22.58 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.11 
 
 		 785 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  20.23 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  24.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  22.22 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  29.47 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  20.23 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  20.23 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  20.23 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  19.92 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  24.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  24.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>