More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1570 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1570  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
312 aa  614  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  35.05 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.9 
 
 
304 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 
302 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  30.54 
 
 
301 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 
304 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  30.98 
 
 
301 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.79 
 
 
302 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  33.2 
 
 
313 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 
302 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.33 
 
 
844 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  32.99 
 
 
316 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 
315 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  32.07 
 
 
327 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  32.48 
 
 
313 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  29.58 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.23 
 
 
323 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.7 
 
 
759 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  28.28 
 
 
307 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  32.31 
 
 
316 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  32.2 
 
 
304 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  34.64 
 
 
302 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  32.31 
 
 
315 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  33.45 
 
 
311 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  32.82 
 
 
286 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  31.97 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  33.98 
 
 
313 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 
315 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  30.64 
 
 
314 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  30.17 
 
 
315 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  30.19 
 
 
359 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  29.97 
 
 
314 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  30.3 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  30.43 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.53 
 
 
856 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  31.88 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  30.87 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  30.92 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 
293 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
844 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 
305 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 
322 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 
322 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 
322 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  30.82 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.69 
 
 
845 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  29.11 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  29.37 
 
 
316 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
322 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  30.11 
 
 
357 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  31.89 
 
 
315 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.56 
 
 
308 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  29.37 
 
 
316 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  29.37 
 
 
316 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.72 
 
 
834 aa  138  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.22 
 
 
307 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  30.46 
 
 
315 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 
334 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  31.37 
 
 
324 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  32.61 
 
 
310 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 
316 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  29.04 
 
 
316 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  30.87 
 
 
313 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  28.71 
 
 
316 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.19 
 
 
302 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  30.88 
 
 
296 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  29.04 
 
 
316 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 
372 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  29.04 
 
 
316 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  34.45 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  29.37 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0940  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 
398 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.494806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 
315 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  32.78 
 
 
321 aa  136  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.67 
 
 
759 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 
315 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 
315 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  29.2 
 
 
322 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  27.15 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  32.55 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  34.03 
 
 
352 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  30.03 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31 
 
 
849 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.97 
 
 
989 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.72 
 
 
785 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.72 
 
 
785 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.8 
 
 
754 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.8 
 
 
754 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.3 
 
 
752 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>