More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4227 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  99.36 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  97.77 
 
 		 314 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2277  protein-export membrane protein SecF  86.31 
 
 		 313 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  81.39 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  81.39 
 
 		 316 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  55.67 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  52.41 
 
 		 319 aa  345  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  50.65 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  50.47 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  51.36 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  49.84 
 
 		 369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  49.09 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  51.63 
 
 		 352 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  55.1 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  47.81 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.03 
 
 		 856 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  43.99 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.1 
 
 		 856 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.87 
 
 		 839 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.26 
 
 		 846 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.23 
 
 		 785 aa  255  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.23 
 
 		 785 aa  254  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.45 
 
 		 759 aa  255  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.21 
 
 		 845 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  42.77 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.61 
 
 		 846 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.49 
 
 		 844 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.05 
 
 		 844 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.05 
 
 		 844 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  41.27 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.38 
 
 		 848 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.22 
 
 		 849 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  40.13 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.55 
 
 		 858 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  40.59 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.86 
 
 		 853 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  35.56 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  35.85 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 		 834 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  41.61 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.61 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  38.3 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  36.81 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  39.65 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  38.54 
 
 		 843 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  37.94 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.55 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.66 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.66 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  36.51 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  37.54 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.41 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  37.82 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  38.31 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  37.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  38.02 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  39.79 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  35.65 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  38.31 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  34.27 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  38.3 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  39.79 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  37.8 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  37.32 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  36.18 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  34.32 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.91 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  35.27 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  32.94 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  34.82 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  34.82 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  34.82 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  33.01 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>