More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2189 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  93.99 
 
 		 316 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  81.39 
 
 		 314 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  81.07 
 
 		 314 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  80.44 
 
 		 314 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2277  protein-export membrane protein SecF  80.7 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  57.19 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  52.85 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  50.32 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  52.22 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  51.54 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  52.22 
 
 		 367 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  49.68 
 
 		 369 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  51.13 
 
 		 352 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  52.9 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  47.47 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.45 
 
 		 856 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.9 
 
 		 856 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  44.16 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.14 
 
 		 846 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.5 
 
 		 839 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.94 
 
 		 844 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.49 
 
 		 846 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.32 
 
 		 785 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.7 
 
 		 759 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.32 
 
 		 785 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40 
 
 		 848 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40 
 
 		 849 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  44.22 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  40.59 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  42.24 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.48 
 
 		 845 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.66 
 
 		 853 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.55 
 
 		 844 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  39.54 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.48 
 
 		 844 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  39.54 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.31 
 
 		 834 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.33 
 
 		 858 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  39.14 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  39.74 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  35.11 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  39.59 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  41.75 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.75 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  37.74 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  35.69 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  38.79 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  35.97 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  40.62 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  41.72 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  39.34 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  41.03 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  40.62 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  40.69 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  35.79 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.14 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.63 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.63 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.16 
 
 		 843 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  36.22 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  38.46 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.84 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.2 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.14 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  35.48 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  34.5 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  33.78 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  33.78 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  37.68 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>