More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2397 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2397  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 433 aa  873    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  0.614956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  33.08 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  32.09 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  32.58 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  32.33 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.56 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  46.07 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  46.07 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  45.9 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  28.15 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  41.98 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  38.17 
 
 		 347 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  41.8 
 
 		 314 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 322 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  44.69 
 
 		 308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  44.97 
 
 		 304 aa  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  41.24 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  45.35 
 
 		 302 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  48.12 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  36.4 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  47.02 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  41.76 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  41.4 
 
 		 302 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  43.1 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.21 
 
 		 286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0673  preprotein translocase subunit SecF  37.75 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.392414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  43.98 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.38 
 
 		 785 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.38 
 
 		 785 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  42.01 
 
 		 313 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  37.44 
 
 		 302 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  41.85 
 
 		 312 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  37.89 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  40.76 
 
 		 759 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  43 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  47.4 
 
 		 301 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  36.15 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  37.16 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  42.69 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  41.51 
 
 		 304 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  41.51 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  44.51 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  42.31 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  44.51 
 
 		 324 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  38.83 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  39.88 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  44.38 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  41.01 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  40.36 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  42.42 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  45 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  42.42 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  35.35 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  45.62 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.89 
 
 		 759 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  39.88 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  40.96 
 
 		 318 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  42.94 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  40.41 
 
 		 317 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  41.57 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  39.88 
 
 		 313 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 303 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  38.21 
 
 		 356 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  41.82 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  42.62 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  37.56 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.18 
 
 		 856 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.78 
 
 		 1055 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  40.96 
 
 		 989 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  43.35 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  38.74 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.28 
 
 		 846 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  45 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  45 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  43.78 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  38.71 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  41.49 
 
 		 740 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  40.72 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  44.31 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.56 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  40.96 
 
 		 310 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  44.38 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  38.01 
 
 		 849 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  38.71 
 
 		 293 aa  137  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  41.14 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 		 735 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  43.71 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  40.43 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  38.17 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  36.25 
 
 		 316 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  39.05 
 
 		 310 aa  136  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>