More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1819 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 356 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  62.04 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  62.12 
 
 		 362 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  59.04 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  56.09 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1928  preprotein translocase subunit SecF  55.94 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  52.77 
 
 		 347 aa  325  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  51.02 
 
 		 351 aa  308  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  46.76 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.62 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.13 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  38.57 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  35.44 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.17 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.38 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  36.26 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  35.45 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  38.89 
 
 		 312 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  37.32 
 
 		 315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  36.54 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  32.86 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.26 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  33.04 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  36.68 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.65 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.26 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  36.5 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  35.28 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  35.67 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  34.51 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  39.1 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  34.81 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  33.6 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  39 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  35.47 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  36.31 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  35.77 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  35.01 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  35.61 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  34.44 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  34.72 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  34.78 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  33.63 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  37.9 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  37.57 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  34.11 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  37.43 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 		 846 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  37.61 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  36.11 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  36.1 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  34.21 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  35.15 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.05 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  36.22 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  36.53 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  37.17 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  33.81 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  35.9 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.52 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.43 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.91 
 
 		 845 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  40.12 
 
 		 323 aa  179  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  33.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.02 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  33.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  33.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  33.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  33.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  36.87 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>