More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3023 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_3023  response regulator receiver protein  100 
 
 
129 aa  254  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
921 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
685 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  44.8 
 
 
632 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
758 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 
455 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.53 
 
 
712 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
477 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1899  response regulator receiver protein  47.15 
 
 
121 aa  100  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
1045 aa  97.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.09 
 
 
700 aa  93.6  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
991 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
896 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
530 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
768 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
769 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
759 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 
440 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  39.2 
 
 
849 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
603 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
544 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
660 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1039 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
656 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
771 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
608 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  36.15 
 
 
812 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
657 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
766 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
886 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
1426 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
753 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
837 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
813 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
550 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
603 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1439 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
765 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
400 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
653 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  38.74 
 
 
559 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
1078 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 
906 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
1253 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
1032 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
593 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
637 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
619 aa  73.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0731  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
644 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
764 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
984 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 
669 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
1276 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
781 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
862 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
783 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1301 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
873 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 
1265 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
666 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
268 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 
1113 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
1039 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
896 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
931 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
789 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
1513 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
720 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
500 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
763 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 
511 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
909 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  33.06 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
878 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 
458 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 
461 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  35.78 
 
 
539 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 
479 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 
450 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
1111 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
2072 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
1300 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
524 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
901 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  37.08 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
641 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
980 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2423  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
670 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808174  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
882 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
1325 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0512  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
945 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>