More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1899 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1899  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3023  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 758 aa  98.2  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 477 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 455 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 619 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 500 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 1045 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 603 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 656 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 603 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 544 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 759 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 660 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 		 637 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 		 837 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 550 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 812 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 768 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 886 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1032 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 		 400 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 685 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 896 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 186 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 608 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 984 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 781 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 921 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.36 
 
 		 700 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  34.4 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 783 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 657 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 769 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 530 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 766 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  38.82 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 1301 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 906 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1265 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 980 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 901 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 849 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.71 
 
 		 712 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 862 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 640 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 472 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 720 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 765 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 764 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 991 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 1513 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 813 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.68 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 632 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 653 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.7 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 763 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 909 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 483 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1439 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 896 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 		 669 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 402 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.23 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1078 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  31.54 
 
 		 559 aa  65.1  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 1039 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 873 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 644 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  32.18 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 753 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0077  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 		 457 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1121 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 1113 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 		 628 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  36.78 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  36.78 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>