280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0383 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0383  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.164826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3027  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
216 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3790  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.73 
 
 
226 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000171716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47010  Carbon monoxide oxidation transcription regulator, Crp/Fnr family: CooA  40.28 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1134  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal  0.0613651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.05 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1233  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0234193  normal  0.501568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.22 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.366643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1089  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
218 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4494  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
232 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.164578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3189  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0800  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0302672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
222 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2046  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
219 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3237  hypothetical protein  33.87 
 
 
261 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0602886  normal  0.0128159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.03 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.25 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.89 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.81 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  26.29 
 
 
267 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.67 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.03 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.51 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.42 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  24.24 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1641  hypothetical protein  25.15 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0118775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.73 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.65 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.81 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.62 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.93 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.06 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.38 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.22 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.41 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.68 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.62 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.31 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0675  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.55 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.13 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.71 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  26.11 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.03 
 
 
243 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  24.06 
 
 
214 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 
254 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  27.22 
 
 
254 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 
247 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.79 
 
 
223 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
229 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.33 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  24.43 
 
 
352 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>