188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0932 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
226 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.366643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3027  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
216 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.37 
 
 
220 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3790  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.73 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000171716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1233  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 
225 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0234193  normal  0.501568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1134  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal  0.0613651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47010  Carbon monoxide oxidation transcription regulator, Crp/Fnr family: CooA  39.53 
 
 
220 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2046  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0383  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.22 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.164826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0800  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.26 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0302672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1089  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
218 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0602886  normal  0.0128159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3189  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
219 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
222 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4494  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.164578 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3237  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  27.39 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.91 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.15 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  24.31 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
235 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.33 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.31 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.52 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.38 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.35 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.27 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.6 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.35 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  23.81 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.44 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.96 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.38 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.97 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 
223 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.51 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  25 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  22.28 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1315  hypothetical protein  21.52 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.37 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.08 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  21.7 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  21.7 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  21.7 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  21.7 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.62 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  22.73 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.46 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.7 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.69 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.46 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>