95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3095 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  55.8 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  49.17 
 
 
134 aa  130  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  43.7 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  32.86 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  39.2 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.88 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  38.1 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.56 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  34.4 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  34.21 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  34.85 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  34.43 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  31.06 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.56 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  29.79 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  30.14 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.11 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  34.46 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  32.17 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  33.86 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  31.39 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  30.89 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  36.29 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  29.79 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.85 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.22 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.97 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  29.93 
 
 
167 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  30.08 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  31.06 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  28.08 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  28.69 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  30.5 
 
 
231 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  35.59 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  29.51 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  29.51 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  33.1 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  27.42 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  33.06 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  24.14 
 
 
199 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  27.87 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.37 
 
 
168 aa  58.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.28 
 
 
283 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32.09 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  30.33 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.03 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.33 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  30.95 
 
 
280 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.07 
 
 
272 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.08 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  25.36 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  26.9 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  30.51 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  27.01 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  34.13 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  30.5 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2841  Protein of unknown function DUF2147  30 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  30.25 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  32.06 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.17 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  27.64 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.37 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  29.63 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  26.32 
 
 
300 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  28.8 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  28.37 
 
 
137 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  29.63 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  28.36 
 
 
111 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  29.41 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.07 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  28.46 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  26.67 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  26.09 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  28.46 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  27.97 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  27.14 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  24.65 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  24.18 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  30.33 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  25.98 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  26.92 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  21.67 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  21.67 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>