134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3048 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  44.93 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  44.8 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  41.5 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  45.52 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  43.08 
 
 		 140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  38.64 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  38.89 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  33.81 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  33.56 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  33.56 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  38.02 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.97 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  34.44 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  36.8 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  36.13 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  36.13 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  34 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  37.14 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  35.77 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  33.1 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  34.71 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.61 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  31.16 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  32.21 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  26.57 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  31.13 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  28.17 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  39.09 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  49.28 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  30.28 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  32.03 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  33.85 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  34.97 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  43.66 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  32.48 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  28.19 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  32.37 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  35.76 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  26.03 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  35.07 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  38.53 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.64 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  29.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  29.08 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  29.41 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  35.85 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  37.61 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  33.85 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  42.25 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  33.82 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  29.5 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.06 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  33.65 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  35.19 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  44.29 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  44.29 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  44.29 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  34.11 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  29.8 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  30.61 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  40.3 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  27.97 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  43.24 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  51.92 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  51.92 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  28.99 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  27.94 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  27.94 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  37.97 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  41.25 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>