131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1853 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  100 
 
 
149 aa  306  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  55.63 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  42.07 
 
 
143 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  46.97 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  48.67 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  46.15 
 
 
145 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  40.83 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  36.91 
 
 
145 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  40 
 
 
157 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  39.68 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  34.97 
 
 
148 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  36.05 
 
 
168 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  33.1 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  39.32 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  37.5 
 
 
143 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  37.6 
 
 
146 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  38.79 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  38.46 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  38.79 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  30.82 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  30.99 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  38.46 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  40.5 
 
 
179 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  36.55 
 
 
143 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.89 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  39.67 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  39.67 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  40.32 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  42.15 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  39.52 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  40.32 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  37.1 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  35.81 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  38.89 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  35.1 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  36.75 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  35.1 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  29.45 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  33.78 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  30.34 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  36.09 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  37.19 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  37.19 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  35.94 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  35.94 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.29 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  34.25 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.06 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  35.03 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  34.81 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  29.87 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  35.03 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  35.03 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  35.03 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  32.08 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  36.36 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  34.01 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  34.01 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  30.3 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  36.5 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  32.9 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  33.99 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  29.14 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  33.11 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  34.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  34.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  34.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  29.05 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  37.93 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  33.62 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  34.11 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  34.4 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  30.51 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.03 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  33.33 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  33.33 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  29.73 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.13 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  28.06 
 
 
231 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  29.23 
 
 
168 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  30.88 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  32.59 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3377  Protein of unknown function DUF2147  30.08 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  29.93 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  31.3 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.07 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>