78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0487 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  77.95 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  77.95 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  77.17 
 
 		 179 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  66.2 
 
 		 169 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  65.49 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  55.73 
 
 		 204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  53.02 
 
 		 203 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  55.2 
 
 		 228 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  51.11 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  53.02 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  48.61 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  53.17 
 
 		 230 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  49.63 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  45.38 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  44 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  45.38 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  44.35 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  42.28 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  40.28 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  43.22 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  39.57 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  42.02 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  38.03 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  41.48 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.19 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  37.06 
 
 		 207 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.97 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  32.68 
 
 		 225 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  35.46 
 
 		 231 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  35.21 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.03 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.66 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  34.67 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.56 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  31.5 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.26 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  31.09 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.21 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  31.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.01 
 
 		 280 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  27.42 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  27.97 
 
 		 283 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32.62 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  26.85 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.23 
 
 		 300 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  26.61 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.87 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  33.72 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.43 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  30.34 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  29.66 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.67 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  25.41 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  28.46 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  25.34 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  32 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  32 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.53 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>