67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0555 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  55.96 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  46.3 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  45.79 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  36.13 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  34.19 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  33.61 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  28.1 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.62 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  33.1 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  30.46 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.64 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  31.45 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  31.16 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  31.54 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  31.94 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  28.36 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  30.25 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  32.12 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.04 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  28.21 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  30.15 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  27.69 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  30.58 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  27.78 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  27.21 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  31.2 
 
 		 204 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.83 
 
 		 272 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.06 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  30.58 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  29.37 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  26.52 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  27.64 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  28.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  27.91 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  29.01 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  32.08 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  26.89 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  30.48 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  25.47 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  30.71 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  26.98 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  21.01 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  25.2 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  26.83 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  27.12 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  27.03 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  23.94 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  25.69 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.83 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  25.23 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>