84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2287 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  99.41 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  86.84 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  78.29 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  66.18 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  64.29 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  50.61 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  47.49 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  49.38 
 
 		 199 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  50.66 
 
 		 204 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  50.76 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  52.8 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  45.51 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  49.38 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  45.81 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  47.01 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  43.09 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  45.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  46.61 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  45.16 
 
 		 123 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  34.36 
 
 		 213 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  41.88 
 
 		 136 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  36.69 
 
 		 231 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  41.91 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  42.66 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  94  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  37.78 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  33.74 
 
 		 207 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  39.17 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  40.85 
 
 		 134 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  40.29 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  88.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  35.46 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  35.86 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.73 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  36.17 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  39.67 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  34.27 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  34.46 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.79 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.5 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.56 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  28.8 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.06 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  33.56 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.46 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  29.51 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31.93 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.82 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  24.83 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  26.71 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.81 
 
 		 168 aa  51.6  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.2 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.27 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  27.97 
 
 		 262 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  30.52 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  41.82 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  28.19 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  30.08 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  23.93 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.41 
 
 		 129 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  32.26 
 
 		 151 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  32.26 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  38.18 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  31.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  30.3 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>