89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3728 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  86.49 
 
 		 133 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  75.4 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  73.87 
 
 		 111 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  62.71 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  38.71 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  40.17 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  36.7 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  34.92 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  34.06 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  35.88 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  37 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  36.09 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  40.4 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  36.52 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  35.92 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  37.76 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.81 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  35.48 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  33.64 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  32.82 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  29.58 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  32.58 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.36 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  31.36 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.82 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.08 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  32.05 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.78 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  33 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  33.88 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  31.69 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  28.03 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  32.35 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  37.25 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  33.67 
 
 		 262 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  32.77 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  27.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  35.25 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  33.64 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  33.64 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  26.8 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  34.95 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  32.2 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  34.95 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  31.45 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  34.43 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  33.05 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28.91 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  30.39 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.26 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  28.93 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  27.27 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  34.69 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  33.04 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  30.7 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  33.85 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  25.78 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  26.19 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  26.24 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  30 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.93 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  27.12 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  33.87 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  32.81 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.2 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>