30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1118 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  91.96 
 
 
112 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  61.95 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  58.93 
 
 
111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  56.07 
 
 
112 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  63.44 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  45.61 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  39.47 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  33.61 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.38 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  36.7 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  35.48 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  30.43 
 
 
137 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  34.86 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  37.14 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  34.55 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.66 
 
 
272 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.58 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.56 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.09 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  38.18 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  38.18 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  38.18 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  26.87 
 
 
213 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>