32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6954 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  63.96 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  56.07 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  56.07 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  54.05 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  54.05 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  44.09 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  41.94 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  32.28 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.56 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.59 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  34.55 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  38.27 
 
 		 280 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.25 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.3 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  26.09 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  32.22 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>