31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0965 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  91.96 
 
 
112 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  61.95 
 
 
113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  58.04 
 
 
111 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  56.07 
 
 
112 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  64.52 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  44.74 
 
 
115 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  36.51 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.59 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  38.32 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.11 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  32.46 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  32.61 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.07 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  36.7 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  36.29 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35.78 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.66 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32.04 
 
 
272 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.16 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.25 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  41.82 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  41.82 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  41.82 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  29.1 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>