42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5099 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  63.96 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  58.93 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  56.99 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  59.14 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  38.05 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  35.16 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  37.17 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  35.51 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  38.81 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  36.09 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  36.45 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  32.09 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  33.96 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  30.09 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  48.89 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  32.69 
 
 		 300 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  36.9 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  32.2 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  31.43 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.21 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.36 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.5 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  27.87 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.09 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  28.36 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  30.85 
 
 		 272 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  39.58 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  31.2 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>