93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4359 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  75.91 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  70.59 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  72.97 
 
 		 111 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  36.23 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  36.89 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  41.03 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  37.98 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  37.1 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.88 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  38.06 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  37.29 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  37.27 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  37.07 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  35.92 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  33.59 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  37.76 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  31.13 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  34.58 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.77 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  33.55 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  31.39 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.93 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.17 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  34.35 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  35.25 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  32.37 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  33 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  32.37 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.97 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  36.73 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  32.89 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  34.96 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  31.08 
 
 		 231 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  34.96 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  36.13 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  32.87 
 
 		 225 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.57 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  29.37 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  32.77 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  30.71 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  37.86 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  31.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  29.51 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  28.86 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  34.31 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  31.45 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  32.04 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  27.97 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.89 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  30.91 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  36.56 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  26.47 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  40 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.19 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  30.43 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  31.48 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  26.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  38.71 
 
 		 202 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  40.32 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  39.06 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.03 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  35.94 
 
 		 157 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  30.63 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  37.68 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  37.68 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  24.6 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>