84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3305 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  83.58 
 
 		 134 aa  236  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  49.25 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  48.87 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  48.89 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  46.27 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  40.15 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  39.13 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  42.15 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  42.15 
 
 		 179 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  39.47 
 
 		 207 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  38.4 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.88 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  41.32 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  41.32 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  37.07 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  37.61 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  38.6 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  35.83 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  36.92 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  36.84 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  35.56 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  36.15 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  38.57 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  35.09 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  34.88 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  34.65 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  38.89 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  36.43 
 
 		 199 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  34.81 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  31.71 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.61 
 
 		 272 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  42.5 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  37.72 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  34.65 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  34.09 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  35.77 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  33.09 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.58 
 
 		 283 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  32.74 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.56 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.17 
 
 		 300 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.75 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  34.17 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  27.5 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  31.93 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  29.46 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.68 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  34.01 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  37.61 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.09 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  28.37 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30.63 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  29.57 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  26.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  30.83 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  23.13 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  26.95 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  27.83 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.52 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.78 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  29.1 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  28.83 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>