25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0627 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  89.57 
 
 
115 aa  186  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  86.96 
 
 
100 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  43.1 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  41.23 
 
 
112 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  42.59 
 
 
111 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  45.74 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  42.27 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  34.38 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  34.88 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  34.58 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  34.62 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  34.96 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  39.05 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.03 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.77 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.71 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31.13 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.03 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  30.61 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  31.65 
 
 
262 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>