85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2038 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  56.25 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  55.96 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  55.96 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  38.26 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  39.29 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  41.28 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  35.16 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  38.28 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  36.51 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  32.28 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  40.37 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  33.81 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.04 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  33.61 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.23 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  29.5 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.04 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  37.38 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  36.04 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.22 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.46 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.16 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  31.94 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.13 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  30.08 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  29.01 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  29.63 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  29.01 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  31.15 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  32.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  29.69 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.67 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  30.65 
 
 		 207 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.41 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  31.11 
 
 		 204 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  31.69 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.85 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  30.5 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  27.73 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  29.79 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  30.47 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.67 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  29.73 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  26.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  29.41 
 
 		 228 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  28.28 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  27.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  27.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  30.83 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  26.79 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.62 
 
 		 149 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  27.41 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  25.98 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  28.87 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  25.55 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  25.35 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  25.62 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>