82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2264 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  65.79 
 
 		 231 aa  298  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  57.27 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  41.04 
 
 		 134 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  43.51 
 
 		 135 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  38.06 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  42.5 
 
 		 147 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  41.46 
 
 		 147 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  35.66 
 
 		 169 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  42.28 
 
 		 146 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  43.22 
 
 		 147 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  37.88 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  37.24 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  38.69 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  38.17 
 
 		 145 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  35.42 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  37.96 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  39.67 
 
 		 123 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  33.52 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.75 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.42 
 
 		 147 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  32.98 
 
 		 178 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  34.56 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  36.89 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  36.89 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  37.7 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  36.09 
 
 		 146 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.88 
 
 		 134 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  38.74 
 
 		 136 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  35.07 
 
 		 154 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  34.43 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  37.82 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.28 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32.62 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  32.84 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  35.4 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  34.43 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.09 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  31.09 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  33.91 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  31.3 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  31.94 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  31.36 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.03 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  26.39 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  31.76 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.36 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  29.2 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  25.76 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  31.53 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  32.23 
 
 		 111 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  28.81 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  31.19 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.29 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  29.29 
 
 		 145 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.77 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  29.03 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  33.77 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  27.55 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  31.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  31.65 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  29.66 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  28.29 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  29.69 
 
 		 146 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.87 
 
 		 148 aa  42  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  26.87 
 
 		 112 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>