72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2677 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  66.67 
 
 		 213 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  53.15 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  38.85 
 
 		 203 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  44.27 
 
 		 135 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  39.69 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  39.51 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  38.96 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  34.12 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  39.31 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  36.81 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  36.69 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  43.59 
 
 		 147 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  42.24 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  40.83 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  41.8 
 
 		 146 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  35.84 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  41.32 
 
 		 145 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  34.36 
 
 		 178 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  38.52 
 
 		 170 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  38.52 
 
 		 170 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  38.02 
 
 		 123 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  38.52 
 
 		 179 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  36.29 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  32.85 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.27 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.09 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.84 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.82 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.74 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  27.45 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  26.96 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.83 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  29.66 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.61 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  32.48 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.99 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  27.59 
 
 		 144 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  29.46 
 
 		 168 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.07 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.12 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  25.2 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.06 
 
 		 134 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  31.69 
 
 		 129 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  31.93 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  26.52 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  27.97 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.68 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  27.34 
 
 		 127 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  32.05 
 
 		 143 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.87 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>