73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4360 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  90.54 
 
 		 169 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  69.67 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  69.67 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  67.19 
 
 		 154 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  67.21 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  62.12 
 
 		 204 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  58.62 
 
 		 203 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  58.16 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  55.64 
 
 		 228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  58.4 
 
 		 228 aa  161  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  57.72 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  51.41 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  45.64 
 
 		 204 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  47.2 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  45.6 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  42.22 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  44.63 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  45.38 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  47.9 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  45.53 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  35.12 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  36.55 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.62 
 
 		 213 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  34.59 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  37.96 
 
 		 135 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  35.25 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  36.75 
 
 		 136 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.53 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  37.96 
 
 		 134 aa  84  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.65 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  33.11 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.25 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.52 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.52 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.08 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.37 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.17 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.43 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  29.27 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.14 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.09 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.14 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  27.5 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  31.15 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  29.87 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.61 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  25.21 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  31.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  26.89 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  29.37 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  26.89 
 
 		 262 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  29.69 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  29.01 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  28.81 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  32 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  32 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  28 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  32.54 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  26.05 
 
 		 156 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>