84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3722 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.8 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  36.5 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.5 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.61 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  35.17 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  33.79 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  36.42 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2841  Protein of unknown function DUF2147  35.42 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  30.14 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  30.14 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.16 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  31.9 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.09 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  29.32 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  27.61 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  25.36 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  25.93 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  31.71 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  27.34 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.06 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.99 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  28.97 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  29.84 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  28.37 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  28.1 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  30.22 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.03 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  29.5 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  28.69 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  29.93 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  31.15 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  30.97 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  28.69 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  27.87 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  26.81 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  26.95 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  26.45 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  26.17 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  29.36 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  31.19 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  26.17 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  27.86 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  30.19 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  30.63 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  31.19 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  22.52 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  24.11 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  23.61 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  27.52 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  32.84 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  24.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  26.27 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  28.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  27.82 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>