94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6081 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  80.14 
 
 		 174 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  68.87 
 
 		 155 aa  225  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  46.79 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  45.7 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  51.61 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  45.51 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  44.72 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  48 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  43.9 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  43.15 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  45.16 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  42.76 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  46.4 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  40.28 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  47.15 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  47.15 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  47.15 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  45.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  43.85 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  45.53 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  35.92 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  43.65 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  41.4 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  47.06 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  47.06 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  36.69 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  43.88 
 
 		 144 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  44.22 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  43.2 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  37.86 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  43.65 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  43.65 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  43.65 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  44.92 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  42.97 
 
 		 144 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  34.65 
 
 		 133 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  32.67 
 
 		 218 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  34.07 
 
 		 218 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  37.67 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  36.18 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  35.53 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  31.17 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  32.52 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  29.23 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.77 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  29.03 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  31.01 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  30.2 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  27.74 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  28.1 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  34.31 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.45 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.95 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  28.91 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  29.94 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  33.73 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  39.06 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  42.55 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  30.91 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  43.06 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  47.06 
 
 		 78 aa  44.3  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  42.25 
 
 		 126 aa  44.3  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.85 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  28.06 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  29.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.62 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  24.14 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.62 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  26.57 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  29.61 
 
 		 199 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  26.45 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  25.78 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  32.84 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  30.43 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  26.42 
 
 		 128 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>