48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2543 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  256  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  36.94 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  36.36 
 
 
214 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  37.08 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  37.1 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  37.1 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  37.1 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  37.14 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  36.49 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  30.3 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  36.71 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  34.85 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  36.71 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  34.09 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.82 
 
 
174 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  39.44 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  37.25 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30.77 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  24.47 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  40.91 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  35.21 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  35.21 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.69 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  38.64 
 
 
151 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  30.77 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  37.31 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  37.31 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  28.85 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  24.53 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  29.2 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>