84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2649 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  45.53 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  47.2 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  40.76 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  40.76 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  46.4 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  40.52 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  44.06 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  43.36 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  44.8 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  45.53 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  44.8 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  44.8 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  42.96 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  46.46 
 
 		 151 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  37.9 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  41.96 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  41.72 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  45.67 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  43.55 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  42.42 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  40.56 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  43.54 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  43.2 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  38.17 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  36.89 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  46.83 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  39.52 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  42.52 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  41.27 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  41.27 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  34.15 
 
 		 133 aa  94.4  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  34.15 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  35.21 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  38.58 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  31.36 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  28.28 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  29.19 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.14 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  31.67 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  29.55 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  27.33 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  24.68 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  28.77 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  29.36 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  33.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  26.03 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  33.72 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  25.16 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.95 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  25.17 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  36.62 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  29.75 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  27.97 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  25.64 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  23.13 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  30.7 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  36.49 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  27.93 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  31.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  30.08 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  21.92 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  29.27 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  27.14 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  24.06 
 
 		 143 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>