35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1542 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  285  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  27.94 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.89 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  28.1 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  29.75 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  32.03 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  26.17 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  31.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  30.83 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  35.19 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  30.2 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  28 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  28.1 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  32.74 
 
 		 283 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  28.87 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  25.6 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  25.98 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  25.17 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  23.53 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.36 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  25.52 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>