98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2798 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  77.42 
 
 		 151 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  76.61 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  70.97 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  66.94 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  58.27 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  58.27 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  58.27 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  58.27 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  56.29 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  56.64 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  56.52 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  60.31 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  53.9 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  58.52 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  58.52 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  58.52 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  60 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  56.92 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  60 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  59.2 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  59.2 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  59.2 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  47.14 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  49.59 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  45.16 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  50.4 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  48.03 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  48.03 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  45.19 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  50.81 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  46.76 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  51.2 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  51.2 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  44.2 
 
 		 202 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  50.38 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  45.95 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  46.34 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  42.36 
 
 		 141 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  43.97 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  43.54 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  48.41 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  41.27 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  35.94 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  36.03 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  37.19 
 
 		 214 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  37.9 
 
 		 218 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  36.59 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  35.07 
 
 		 218 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.1 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  36.69 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  35.97 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  32.17 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  34.25 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  42.86 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  26.49 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  33.61 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  29.68 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  29.8 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34.86 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32.67 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  43.75 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  28.35 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.01 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  28.66 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  41.27 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  33.54 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  26.71 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  42 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  30.6 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.85 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  27.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  24.73 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  35.38 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  26.24 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  22.52 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  23.36 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  26.52 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>