81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3518 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  60.84 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  61.27 
 
 		 146 aa  179  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  59.38 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  62.9 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  62.9 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  56.8 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  46.4 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  45.6 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  46.34 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  44.35 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  42.95 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  41.96 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  43.9 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  45.71 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  43.15 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  42.76 
 
 		 161 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  45 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  43.26 
 
 		 153 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  45.9 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  42.96 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  43.55 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  43.26 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  45.04 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  43.26 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  43.26 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  42.97 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  41.86 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  40.28 
 
 		 174 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  43.57 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  43.18 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  40.34 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  42.25 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  43.15 
 
 		 202 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  43.65 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  37.59 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  36.99 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  36.99 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  30.14 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  35.43 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  36.59 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  35.43 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  41.25 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  30.41 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.19 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.54 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  29.51 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  46.3 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  27.74 
 
 		 173 aa  48.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  35.06 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  24.68 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  30.95 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  39.73 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  26.62 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  27.73 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  27.52 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  24.24 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  31.4 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  48.94 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  27.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  28.87 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  22.67 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>