85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09958 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  48.94 
 
 
142 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  41.55 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  45.04 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  45.8 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  45.04 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  45.04 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  41.78 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  42.96 
 
 
161 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  45.83 
 
 
152 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  37.93 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  43.66 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  44.27 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  40.85 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  40.85 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  40.85 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  40.85 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  47.93 
 
 
144 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  43.41 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  37.76 
 
 
174 aa  105  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  42.98 
 
 
168 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  45.83 
 
 
151 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  45 
 
 
151 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  40.14 
 
 
144 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  40.14 
 
 
144 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  45.83 
 
 
157 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  45.53 
 
 
153 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  45.53 
 
 
153 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  45.97 
 
 
147 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  45.53 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  45.53 
 
 
153 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  43.9 
 
 
153 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  38.62 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  45.9 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  39.52 
 
 
147 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  38.35 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  35.21 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  39.55 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  40.16 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  40.16 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  41.8 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  38.66 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  37.1 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  34.69 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  30.5 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  31.06 
 
 
202 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  31.33 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  30.89 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  32.17 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  29.92 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  32.84 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  29.37 
 
 
217 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.39 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  31.94 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  26.28 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  32.76 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  30.61 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.28 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  29.45 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  33.33 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  27.41 
 
 
199 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  27.74 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.07 
 
 
143 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.13 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  38.1 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  25.68 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  29.75 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  29.75 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.28 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  27.78 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  31.5 
 
 
228 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  29.92 
 
 
230 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  29.92 
 
 
228 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  28.68 
 
 
188 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  36.51 
 
 
204 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  24.82 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  29.6 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>