109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2925 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  67.11 
 
 
149 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  47.3 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  45.95 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  46.31 
 
 
153 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  46.31 
 
 
153 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  46.31 
 
 
153 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  46.31 
 
 
153 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  45.27 
 
 
161 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  49.19 
 
 
157 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  47.41 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  47.41 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  49.19 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  47.41 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  49.19 
 
 
153 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  43.05 
 
 
153 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  49.19 
 
 
153 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  46.15 
 
 
153 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  45.77 
 
 
153 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  43.17 
 
 
144 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  43.17 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  47.58 
 
 
153 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  44.06 
 
 
174 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  46.34 
 
 
153 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  47.2 
 
 
153 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  43.2 
 
 
166 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  43.06 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  48.39 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  50.81 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  39.16 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  50.81 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  43.2 
 
 
168 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  42.14 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  41.91 
 
 
155 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  47.93 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  45.9 
 
 
144 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  48 
 
 
147 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  43.17 
 
 
146 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  41.22 
 
 
148 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  38.52 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  37.93 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  37.7 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  37.7 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  36.09 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  35.14 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  37.41 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  36.73 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  34.56 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  34.93 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  30.07 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  34.23 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  44.29 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  50.79 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  43.48 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  34.78 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  30.16 
 
 
186 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.61 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  31.4 
 
 
214 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.88 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  25.81 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  28.67 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  33.33 
 
 
168 aa  53.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.76 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  44.93 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  28.03 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  29.61 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  35.38 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  34.52 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  28.46 
 
 
218 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  31.51 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  33.98 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  29.49 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.34 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.76 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  45.16 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  28.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  34.57 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  33.56 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  29.11 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  28.35 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  27.7 
 
 
165 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  30.37 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  27.03 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  39.71 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.94 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  26.83 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  41.79 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  37.14 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  40.91 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.85 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  27.03 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  25.62 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  40.32 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  29.58 
 
 
213 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  27.08 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  29.58 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>