79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2734 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  61.02 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  58.82 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  57.14 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  59.13 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  56.67 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  57.63 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  55.83 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  46.72 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  45.53 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  43.31 
 
 		 204 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  48.76 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  42.28 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  39.72 
 
 		 178 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  41.32 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  39.5 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  36.67 
 
 		 204 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  40.65 
 
 		 202 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  43.8 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  44.63 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  39.67 
 
 		 199 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  44.63 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  41.6 
 
 		 228 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  41.6 
 
 		 230 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  41.32 
 
 		 228 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  39.84 
 
 		 134 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  39.32 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  32.05 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  39.5 
 
 		 207 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  41.18 
 
 		 231 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  36.52 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  36.67 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.85 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  36.67 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  35.1 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  34.71 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  29.86 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  32.8 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32.2 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  31.03 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.5 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  35.83 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.93 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.04 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  32.48 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.17 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  31.09 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.2 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  30.83 
 
 		 262 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.17 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  29.52 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  31.93 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  25.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  28.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  25.64 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  31.97 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  25.71 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  28.69 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  28.69 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2841  Protein of unknown function DUF2147  25 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  42  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  33.72 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  23.08 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>