66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1884 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  42.74 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  41.12 
 
 		 280 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  40.5 
 
 		 283 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.09 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  38.39 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.58 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  34.11 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  38.14 
 
 		 262 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  38.61 
 
 		 300 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  31.54 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  37.07 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  38.38 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  40.4 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  32.31 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  30.66 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  36.13 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  34.45 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  31.97 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  35.35 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  34.43 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.03 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  31 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  30.61 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  32.77 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  27.48 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  27.41 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  29.85 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  33.07 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  27.89 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  28.81 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.93 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.93 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  26.72 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  28 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  34.04 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  25.19 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  27.2 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  27.87 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  27.87 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  24.79 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  24.19 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  31.91 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  23.89 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  26.96 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  25.55 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  30.14 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  32.98 
 
 		 113 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  30.33 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  30.33 
 
 		 151 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>