53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3698 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  41 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  41 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  42 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.89 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  28.18 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.03 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  24.3 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.15 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  32.12 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  34 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  30.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  32.85 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  27.74 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  29.46 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  26.24 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  29.46 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  26.77 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  29.1 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  28.21 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  27.34 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  28.89 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  31 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  28.79 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  30.58 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  31.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  28.89 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  22.92 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  26.32 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  26.12 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  25.83 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  28.78 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  26.43 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>