84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2668 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  95.92 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  83.67 
 
 		 146 aa  251  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  60.16 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  52.1 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  48.89 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  39.29 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  38.57 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  41.38 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  35.97 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  39.67 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  39.67 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  34.42 
 
 		 213 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  34.53 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  41.23 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  38.84 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  38.41 
 
 		 204 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  40.5 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  38.93 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  35.92 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  36.07 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  39.69 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  36.55 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  33.77 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.33 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  32.84 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  39.82 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  32.03 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  35.65 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  35 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  30.58 
 
 		 228 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  34.72 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  30.6 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  35.09 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  31.72 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  34.56 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35.34 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.29 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  26.25 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  38.17 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  34.51 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  33.93 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  32.17 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  33.59 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  32.8 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32.41 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  35.34 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  28.47 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  30.09 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  30.47 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  28.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  33.04 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  34.85 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.7 
 
 		 262 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.36 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  32.06 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  32.17 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  26.35 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  28.44 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  33.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  28.1 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  29.2 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  28.37 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  25.19 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>