43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1419 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  65.18 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  56.25 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  56.48 
 
 		 112 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  54.05 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  52.68 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  41.59 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  38.28 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.11 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  33.08 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  36.28 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.12 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  33.93 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  34.95 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  29.66 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  32.04 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.7 
 
 		 272 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  26.76 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  30.71 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  37.68 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  37.68 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  25.23 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  42.31 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  34.55 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  40  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>