85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1379 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  41.61 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.48 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  32.2 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  34.53 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  34.53 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  32.76 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  34.96 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  32.35 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  36.07 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  34.92 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  33.82 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.13 
 
 		 225 aa  72  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  31.88 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  35.04 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  31.15 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  34.44 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.33 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  32.58 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.22 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  36.03 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.91 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.2 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  30.16 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  35.2 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.77 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  32.79 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  29.25 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.15 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  32.23 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.59 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  25 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  31.3 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  28.36 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  29.41 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.87 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  26.17 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  27.43 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  26.23 
 
 		 300 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  31.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  24.41 
 
 		 119 aa  47.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.27 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  29.7 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  28.69 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  29.08 
 
 		 127 aa  43.9  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  29.75 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  29.75 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  29.27 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  30.25 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  26.27 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  26.47 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  26.24 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  25.87 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  31.15 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  23.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  24.31 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  26.27 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  25.36 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>